Nació en 1978 como una organización gubernamental y en 1987 se incorporó la colaboración del sector productivo regional. Desde 1997 es una asociación civil sin fines de lucro, con personería jurídica de derecho privado, con miembros de otras regiones del país.
En 1999 CIATI fue acreditada, según [[ISO ]] 17025, por la Entidad Nacional de Acreditación de España (ENAC), acreditación revalidada en mayo de 2008. Ésto le vale el reconocimiento de otros países de la Unión Europea. Está dirigido por un Comité Directivo responsable de las decisiones y supervisión general del Centro. Integran el Comité representantes de las empresas asociadas, que incluyen a asociaciones intermedias, cámaras, cooperativas y empresas privadas dedicadas a la producción, empaque e industrialización de frutas y hortalizas, así como de los gobiernos de las provincias de Río Negro y Neuquén y del [[INTA]].