El software MediaWiki usado por esta enciclopedia usa marcadores especiales de '''categoría cyt-ar''', <nowiki>[[categoríaCategoría:''tema'']]</nowiki>, para agrupar o clasificar los artículos que corresponden a un ''tema'' dado. La [[función]] principal de las categorías es permitir encontrar la mayor cantidad posible de artículos que se refieren a ese tema, aunque sólo sea de modo parcial o secundario. Por ejemplo, si se busca ''categoría:información'', aparecerá una lista, ordenada alfabéticamente, de todos los artículos y archivos categorizados con el marcador <nowiki>[[categoríaCategoría:información]]</nowiki>. La búsqueda por categorías cumple para los artículos de esta enciclopedia la misma función que un diccionario de ideas afines cumple para las palabras.
Conviene comenzar con ejemplos concretos, para lo que se tomarán los casos extremos de artículos correspondiente a un tema muy amplio y otro muy reducido: el del reactor nuclear [[CAREM]] y el de la [[provincia de Río Negro]]. El primero es un dispositivo del cual había en el momento en que se escribió el artículo, octubre de 2009, sólo un prototipo, pero cuyas características e historia son de gran complejidad. El segundo corresponde a un vasto territorio con una larga historia y gran variedad de instituciones, aunque seguramente de mucho menor complejidad que la provincia de Buenos Aires.
Es obvio en el primer caso que no se justifica introducir la categoría ''CAREM'', donde sería el único artículo. Tampoco se justifica crear la categoría ''reactores nucleares'', de los que en 2010 había una decena en Argentina o hechos por empresas argentinas en otras partes del mundo. Se lo ha categorizado inicialmente como <nowiki>[[categoríaCategoría:energía</nowiki> que corresponde a su función principal y permite compararlo con otras fuentes de energía, como las renovables. Si Argentina emprendiera el camino de generación de electricidad por vía predominantemente nuclear, probablemente se justificaría crear la categoría ''energía nuclear'', pero no era el caso en 2010.
El tema [[provincia de Río Negro]] es mucho más amplio y parecería más razonable asignarle una categoría propia. Sin embargo, lo mismo cabe para todas las provincias argentinas, lo que agotaría 1/4 de las categorías. Lo que hay que hacer en este caso es usar dos categorías concurrentes, que en este caso se eligieron como <nowiki>[[categoríaCategoría:territorio]]</nowiki> y <nowiki>[[categoríaCategoría:política]]</nowiki>. Esto corresponde a la definición de provincia como ''división política del territorio'' (al igual que departamento o municipalidad). Usada de esta manera la adición de categorías corresponde a lo que en Matemática se denomina ''intersección de conjuntos'', es decir, el artículo corresponde simultáneamente a los temas de todas las categorías. Para aclarar el tema se da a continuación otro ejemplo:
* [[CONICET]]: <nowiki>[[categoríaCategoría:organismos estatales]]</nowiki>, <nowiki>[[categoríaCategoría:ciencias]]</nowiki>, <nowiki>[[categoríaCategoría:tecnologías]]</nowiki>. Se usa el plural en todos los casos, tema que se discute en la siguiente sección.
==Categorías de intensión y de extensión==
La recomendación de [http://es.wikipedia.org/ Wikipedia] es usar el singular para todas las categorías, recomendación que no se sigue en esta enciclopedia por la siguiente razón. Hay dos clases completamente diferentes de artículos, los que discuten conceptos (definiciones o descripciones) y los que dan hechos o procesos o enumeraciones de integrantes de algún grupo correspondiente a un concepto. En [[categoría Categoría cyt-ar]], este artículo, se discute qué es una ''categoría'' en esta enciclopedia y los fundamentos de la convención usada. En el artículo [[categorías cyt-ar]], en cambio, se da la lista de las únicas categorías que pueden ser usadas en cada artículo hasta tanto se acuerde (requisito obligatorio) la incorporación de otras adicionales. Se han denominado a las primeras categorías de intensión y a las segundas de extensión, a semejanza de los dos tipos principales de definiciones.