En el año 2009 Vialidad Nacional informó que realizaría mejoras del acceso vial a las instalaciones, obras que incluyen la construcción de un empalme a la ruta 40, la pavimentación del acceso a la planta y la construcción de un puente sobre el río Pichileufu con un costo de casi $ 47 millones.[http://www.rionegro.com.ar/diario/rn/nota.aspx?idart=374802&idcat=9544&tipo=2] El 29 de julio de 2009 la CNEA solicitó el uso de ''agua pública'' para ''consumo humano y refrigeración en el Complejo Tecnológico Pilcaniyeu''. El 28 de abril de 2010 un edicto del Departamento Provincial de Aguas (DPA) autorizó a la CNEA a derivar aproximadamente 1 millón de litros de agua por día del río Pichileufu para ''consumo humano y sanitarios'', sin mencionar los riesgos de contaminación que podrían sobrevenir, los que debieron haber sido objeto de un dictamen previo del [http://www.rionegro.gov.ar/empresas/codema/leyes/index.php Consejo de Ecología y Medio Ambiente] (CODEMA). Cuando se divulgó esta autorización los pobladores de la zona requirieron más información sobre el uso que se daría a esa agua en una nota donde señalan que[http://www.rionegro.com.ar/diario/rn/nota.aspx?idart=367039&idcat=9546&tipo=2]
:''Éste es un río de costas contrastantes entre invierno y verano, aguas abajo se usa para riego, bebedero de animales, consumo humano, de familias y escuelas, también como espacio de recreación para gente de la zona o pescadores. Tememos que la reducción del caudal, que ya es poco en verano, nos afecte visiblemente a la zona de Pichileufu, Paso de los Molles, Melicó, Corralito.''
El 27 de mayo de 2010 se llevó a cabo una reunión en la que participaron representantes de la CNEA, DPA y CODEMA, donde los primeros informaron las tareas de enriquecimiento de uranio que se estaban llevando a cabo en el complejo. Los vecinos asistentes decidieron formar una Comisión de Seguimiento para oponerse a la pretensión de la CNEA y bregar para que el DPA no autorice el pedido. Impulsarán, asimismo, que el Concejo Deliberante de Pilcaniyeu establezca al ejido como Municipio No Nuclear, y pedirán a organizaciones ambientalistas de la región y de otros lugares la ''solidaridad ante este atropello a la naturaleza´´naturaleza''.[http://www.anbariloche.com.ar/noticia.php?nota=14824] Hay antecedentes sobre el tema en la provincia de Río Negro, donde la cercana Municipalidad de El Bolsón se declaró Municipio No Nuclear en la década de 1990.