El 22 de abril del año 1955, como consecuencia del ''[[affaire Richter]]'', se firmó el convenio que lo creó como ''Instituto de Física de Bariloche''. El Centro Atómico Bariloche encomendaba a sus investigadores las actividades docentes, proporcionaba alojamiento a los estudiantes y brindaba el uso de sus instalaciones y laboratorios, mientras la Universidad Nacional de Cuyo pagaba los sueldos docentes y emitía los títulos académicos. Su primer director fue el Dr. en Física José Antonio Balseiro, con cuyo nombre fue rebautizado en 1962 luego , después de su muerte.
Las actividades académicas comenzaron el 1 de agosto de 1955, con 15 alumnos estudiantes y 8 docentes. Los primeros Licenciados en Física egresaron el 20 de mayo de 1958 y el 26 de ese mismo mes y año se aprobó la primera tesis doctoral.
==Estudios==
Desde su creación todos sus estudiantes tienen dedicación exclusiva a sus estudios. Para ello reciben una beca que les permite, si lo desean, residir fuera de las instalaciones. El Instituto tiene rigurosas exigencias de regularidad y rendimiento para el mantenimiento de las becas,tales como aprobar al final de cada semestre todas las asignaturas cursadas y mantener un buen promedio de calificaciones. Una de las claves de la buena formación es que durante los últimos años de estudio los estudiantes trabajan en los laboratorios junto a los investigadores, aprendiendo de ellos en la práctica cotidiana.
El 5 de abril de 1977 se crea creó la carrera de Ingeniería Nuclear, cuyo primeros estudiantes ingresan y el 1 de agosto de ese año. El 19 de junio de 1981 egresan los primeros Ingenieros Nucleares y el 1 de septiembre de 1986 se rinde la primera tesis doctoral de esta orientación. En el año 2002 se crea la carrera de Ingeniería Mecánica, en 2002 la Maestría en Ciencias Físicas y en 2003 la Maestría en Física Médica.
Durante el ciclo lectivo 2005 el Instituto ofreció 3 títulos de grado y 5 de posgrado:
** Doctorado en Ciencias de la Ingeniería;
** Doctorado en Ingeniería Nuclear.
==Relaciones con la comunidad==
Durante muchos años el Instituto Balseiro se mantuvo aislado de la comunidad de Bariloche (y del resto del país), salvo la realización en su salón de actos de conferencias públicas de personalidades destacadas, la exhibición semanal de películas por su Cine Club y fiestas estudiantiles de fin de semana. Esta tendencia comenzó a revertirse en la década de 1980, cuando se realizaron actividades culturales que atrajeron la concurrencia de residentes de Bariloche.
Actualmente hace de modo regular ferias de ciencias en la ciudad. Desde el 2002 beca anualmente, por concurso de monografías, a 15 estudiantes de los dos últimos años de centros de enseñanza media de todo el país para que convivan unos días en sus instalaciones [http://rionegro.com.ar/diario/2009/10/12/125531331491.php]. Otorga también anualmente, en conjunción con otras instituciones y empresas, el premio [[IB50k]] para fomentar el desarrollo tecnológico [http://rionegro.com.ar/diario/2009/08/21/1250862951.php].