El primer método usado para ayudar a la identificación de los niños apropiados por los militares fue el de análisis de tipos sanguíneos (grupos A, B, 0 y Rh). Estos análisis eran poco concluyentes, ya que sólo podían excluir casos, pero no asegurar una relación de parentesco.
El primer método que llegó a tener alta capacidad de identificación de parentesco (en particular con los abuelos) fue el de análisis de [http://es.wikipedia.org/wiki/HLA antígenos leucocitarios humanos] (HLA) que se encuentran en los glóbulos blancos de la sangre. Debido a la alta especificidad (gran variabilidad entre diferentes personas) de las respuestas inmunes, el método fue elegido por la genetista [http://es.wikipedia.org/wiki/Mary-Claire_King Mary-Claire King] y un grupo de colaboradores en la sede Berkeley de la Universidad de California. La primera persona identificada por este método — — hubo 22 casos previos de identicación exitosa por otras evidencias— evidencias— fue Paula Eva Logares en 1984. Su caso fue particularmente favorable porque su tipo de HLA era poco común en Argentina, por lo que se estimó que la probabilidad de error en la identificación era de sólo 0,1%[http://journals.lww.com/amjforensicmedicine/toc/1984/12000#-131199074]. King, una activista de los derechos humanos, desarrolló posteriormente otro método basado en el análisis de DNA mitocondrial, que también se aplicó para desaparecidos en otros países.
Los desarrollos de King, quien desarrolló una relación afectiva con algunas de las abuelas, se contaron entre los primeros hechos en el mundo para la identificación de personas. En una entrevista para la revista Discovery, la genetista señaló que ''En Argentina, el árbol familiar es tanto una realidad biológica como cultural. La ciencia no está separada de la vida''.