En diciembre de 2007, al asumir la presidente Cristina Fernández, se dio al sector estatus independiente como Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva. El hecho de que sea hoy un ministerio separado del de Educación sugiere que no se considera que esta última tenga mucho que ver con la ciencia y la tecnología, un grave error. El monto asignado en el presupuesto 2009 a la Finalidad Servicios Sociales – Ciencia y Técnica es de 4.363 millones de pesos sobre un total de 233.818 (el 1,9%). Por Decreto 257/2009 del Poder Ejecutivo Nacional se encomendó al Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva la reglamentación e implementación del Sistema de Información de Ciencia y Tecnología Argentino (SICyTAR) creado por Decreto 443/2004 y se lo faculta a establecer un Sistema de Evaluación Permanente del Sistema Nacional de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva (SECTeIP).