La obra debía estar finalizada en 1987, pero hacia fines de 1994 su avance había sido de sólo el 70%. En ese momento, el gobierno de Carlos Saúl Menem trató de privatizar las centrales nucleares Atucha I y Embalse, aunque manteniendo el compromiso contractual de concluir con Atucha II. La oferta debió tomar forma mediante la privatización de la empresa Genuar (Generación Nuclear Argentina) que fue precedida por la disolución de ENACE y la paralización de Atucha II.[http://www.inversorenergetico.com/v1/index_newsletter.php?id=1042]
Paralizada durante un largo tiempo, tuvo un alto costo de mantenimiento que algunas fuentes estiman en [[USD]] 3.000millones. A fines del 2006, durante la presidencia de Néstor Kirchner, se reanudaron las obras, que incluyen su rediseño para la actualización de las tecnologías a usar. Aunque originalmente se planteó terminarla en el año 2010Como ya sucedió con la Represa Binacional Yacyretá, con Atucha II demandará casi tres décadas de construcción y un costo mucho mayor que el estimado inicialmente. Según informaciones de [[USDNA-SA]], el organismo estatal responsable, la obra será inaugurada en septiembre de 2011 y funcionará a pleno a partir de 2012. Según el diario Perfil, en 2005, cuando se analizó retomar la construcción de la central se estimaba un costo de USD 1700 millones para terminarla.800 Según declaraciones de directivos de NA-SA el 31 de mayo de 2011, Día Nacional de la Energía Atomíca, el costo será de USD 2.200 millones a contar . Como según la misma fuente ''Levantar una central nuclear desde 2006cero tiene un costo que supera los USD 3.000 millones. Como Es decir, teniendo en cuenta el costo de mantenimiento durante todos los fondos acordados y años que la obra estuvo suspendida, el ritmo costo de terminar Atucha II será muy superior al de las obras han disminuidouna central nueva, no se sabe con certeza cuando estará completamente operativaprobablemente el doble.[http://www.inversorenergetico.com/v1/index_newsletter. php?id=1963]