* Basura arrojada por turistas y residentes en los bosques y cuerpos de agua. El Municipio no hace campañas educativas y anualmente se acumulan toneladas de basura en las montañas y las playas del ejido, recogidas también anualmente por esforzados voluntarios con cooperación del [http://www.clubandino.org/ Club Andino Bariloche].[http://www.rionegro.com.ar/diario/rn/nota.aspx?idart=604080&idcat=9546&tipo=2]
* Excepciones a las ordenanzas municipales que ponen límite a la ocupación humana (Plan Director y su expresión en los códigos de Planeamiento y de Edificación).
* Contaminación del lago Nahuel Huapi por embarcaciones, actividades costeras y vertido de líquidos cloacales crudos. Los múltiples organismos responsables, Prefectura Naval, [[Parque Nacional Nahuel Huapi]], Cooperativa de Electricidad Bariloche, [[Departamento Provincial de Aguas]] y Municipalidad de Bariloche no coordinan sus acciones ni las toman en tiempo y forma.[http://www.rionegro.com.ar/diario/rn/print.aspx?idArt=433953&tipo=2] Se ha solicitado colaboración al [http://www.enohsa.gov.ar/ ENHOSA].[http://www.rionegro.com.ar/diario/rn/nota.aspx?idart=442320&idcat=9546&tipo=2] Se desconoce el efecto de las actividades tecnológicas de [[INVAP]]. El [[Centro Atómico Bariloche]] ha hecho estudios de impacto ambiental, pero subsisten dudas en la comunidad sobre el reactor nuclear RA-6[http://www.anbariloche.com.ar/noticia.php?nota=20028].
* Tala de bosques. El provincial Servicio Forestal Andino carece de capacidad operativa.
* Vertedero Municipal. El vertedero de residuos colmó su capacidad alrededor del año 2000 y en marzo de 2011 todavía no se había formulado el método de su reemplazo ni se había organizado la separación domiciliaria para facilitar el reciclado de los residuos de ese origen.[http://www.anbariloche.com.ar/noticia.php?nota=19642] Hay escasos controles sobre la generación de residuos tóxicos en instituciones como restoranes, estaciones de servicios e instalaciones tecnológicas del ejido. La [http://www.reciclarbariloche.com.ar/ Asociación de Recicladores Bariloche] hace separación de residuos reciclables en el propio vertedero, pero no hay métodos de disposición final segura de residuos peligrosos como pilas y materiales electrónicos. Hay frecuentes incendios, probablemente debido a la falta de recaudos para el venteo del metano generado por la descomposición de los residuos orgánicos.